میکسرهای مستغرق در سیستم های بی هوازی و هوازی جهت جلوگیری از ته نشین شدن ذرات و همچنین اختلاط کامل بکار گرفته می شوند . از این میکسرها برای مصارف گوناگونی چون متعادل سازی جریان ورودی، خنثی سازی pH، هوادهی، بر هم زدن لایه بندی مخازن، همگن سازی، جلوگیری از ته نشینی مواد و… استفاده می گردد. از مزایای این سیستم ها می توان به مناسب بودن آن ها برای مخازن با عمق مختلف، حجم بر هم زنندگی و اختلاط آب بسیار بالا، عدم پاشش محلول به بیرون از مخزن به دلیل مستغرق بودن میکسر، راندمان بسیار بالا این نوع میکسرها، تعمیر و نگهداری با هزینه کم و سهولت در نصب و راه اندازی اشاره کرد.